甲基化检测是肿瘤早筛的核心技术之一，通过检测肿瘤特异性甲基化位点，可实现肿瘤的早期、无创筛查。该方案的核心是原料级供应，企业可基于这些原料组装成完整的 IVD 试剂盒，也可直接用于实验室检测。方案中所有试剂均经过性能验证，可直接用于临床样本检测，大幅缩短研发周期。
一、整体方案概览
核心定位
应用场景：肿瘤早筛（肠癌、胃癌、宫颈癌等高发癌种）
核心技术：基于MSP-PCR（甲基化特异性 PCR） 的甲基化检测
定价体系：
样本前处理：协商沟通
基因检测：协商沟通
聚合酶/ 酶：协商沟通
五大模块：覆盖从核酸提取到最终 PCR 检测的全流程，可单独采购，也可组合成完整试剂盒
二、五大核心模块深度拆解
模块一：核酸提取类（磁珠法）
核心作用：从不同类型样本中提取合格的 DNA，为后续甲基化转化做准备
提取类型 | 适用样本 / 特点 |
游离 DNA 提取 | 血浆 cfDNA（肿瘤早筛核心样本） |
脱落细胞 DNA 提取 | 尿液、食管、宫颈脱落细胞，离心沉淀后体积 < 250μl |
固定细胞 DNA 提取 | 甲醛 / 戊二醛固定细胞，离心沉淀后体积 < 250μl |
石蜡切片 DNA 提取 | <5 张石蜡切片，自带石蜡油脱蜡步骤 |
技术优势：磁珠法提取，自动化兼容性好，适合高通量样本处理，提取效率稳定。
模块二：亚硫酸盐转化试剂（金标准方案）
核心作用：将未甲基化的 C 转化为 U，甲基化的 C 保持不变，是甲基化检测的金标准步骤
技术特征：液态亚硫酸盐溶液 + 甲基化转化保护剂，甲基化转化率 > 99.6%
核心优势：恒温转化，无需变温仪，易于自动化，转化效率高、重复性好
适配样本：血浆 cfDNA、基因组 gDNA，兼容肿瘤早筛 PCR 试剂
模块三：DNA 聚合酶和缓冲液（4× 预混）
核心作用：甲基化 PCR 的核心酶体系，保障扩增特异性
技术特征：专为甲基化 MSP-PCR 设计，兼容 Taqman 探针（推荐）和染料法
核心优势：对 CpG 位点敏感，特异性强。热启动性能好，活性封闭率 > 99.3%，有效抑制非特异性扩增
适配原理：兼容 MSP 原理、MethyLight 原理的甲基化 PCR 体系
模块四：甲基化基因引物 / 探针 25×Mix
核心作用：针对肿瘤特异性甲基化位点的 PCR 扩增引物 / 探针，直接可用
技术特征：包含 Septin 9 等抑癌基因、ACTB 内参基因
核心优势：已通过临床样品验证，高灵敏度、高特异性。支持新基因定制开发
适配癌种：肠癌、胃癌、食管癌、宫颈癌、子宫内膜癌、肝癌等肿瘤早筛 PCR
模块五：整体甲基化试剂盒（按模块和基因数计价）
核心作用：针对特定癌种的完整试剂盒方案，已完成性能验证，可直接用于检测
技术特征：针对肠癌（血液 cfDNA）、胃癌（血液 cfDNA）、宫颈癌（脱落细胞）等癌种，完成全流程性能验证
定价逻辑：按检测基因数量计费
三、成熟癌种检测方案（表格详解）
下方表格是已经验证好的、可直接落地的肿瘤早筛甲基化检测方案：
目标基因 | 适用癌种 | 样本类型 |
Septin 9 | 肠癌 / 胃癌 / 食管癌 | 血浆 ctDNA |
PAX1 / JAM3 | 宫颈癌 / 子宫内膜癌 | 脱落细胞 / 石蜡组织 |
CDO1 / CELF4 | 宫颈癌 / 子宫内膜癌 | 脱落细胞 / 石蜡组织 |
ASTN1 / ITGA4 / RXFP3 / SOX17 / ZNF671 | 宫颈癌 | 脱落细胞 / 石蜡组织 |
ZNF154 | 食管癌 | 脱落细胞 |
BCAT1 | 肠癌 | 血浆 ctDNA |
四、方案核心优势 & 适用人群
核心优势
全流程覆盖：从样本提取到 PCR 检测，一站式解决，无需自行搭配试剂
高性价比：单份检测成本低，适合大规模肿瘤早筛项目
临床验证充分：引物 / 探针、试剂盒均经过临床样品验证，可直接用于 IVD 开发
自动化友好：恒温转化、磁珠法提取，适配自动化工作站，适合高通量检测
定制化灵活：支持新基因、新癌种的定制开发
适用人群：
分子诊断实验室：开展肿瘤早筛甲基化检测项目
IVD 企业：开发肿瘤早筛甲基化检测试剂盒
第三方检验所：搭建高通量甲基化检测平台
科研机构：肿瘤甲基化标志物研究